MySQL5.6版本以前，如果配置不当，会导致安装目录下的ibdata1文件过大，磁盘空间会逐渐被占用，直到被占满，会导致软件的异常，以下操作可以解决该问题。

1.导出数据库备份

停掉应用程序，远程连接服务器，不需要进入mysql命令，直接导出数据，用户名和密码为数据库实际用户名和密码

[root@OUTER mysql]# mysqldump -uroot –proot --all-databases  --add-drop-database > /root/all_mysql.sql

2.停止MySQL服务

[root@OUTER mysql]# service mysql stop

3.修改MySQL配置文件/etc/my.cnf

[root@OUTER mysql]# vim /etc/my.cnf

在[mysqld]选项下增加

innodb_file_per_table=1

4.删除/var/lib/mysql下的ibdata1、ib_logfile0、ib_logfile1

[root@OUTER mysql]# rm -f ibdata1 ib_logfile*

5.启MySQL服务

[root@OUTER mysql]# service mysql start

6.导入备份数据

[root@OUTER mysql]# mysql -uroot -proot

mysql> source /root/all_mysql.sql;

7.查看修改是否生效

mysql> show variables like '%per_table%';

值为ON的时候说明修改生效。